神经外科是上海交通大学医学院附属第三人民医院重点学科之一，也是上海交通大学医学院重点建设学科和硕士学位授予点。学科建立的主要研究方向为颅脑损伤、脑血管病及脑与椎管肿瘤等神经外科疾病，近几年来在临床诊治、学科建设、科学研究及人才培养等方面取得快速发展和进步，已成为上海北翼及其邻近省市神经外科疾病尤其是重型颅脑损伤患者与脑血管疾病患者的抢救、转诊与会诊中心，在上海北翼及邻近省市具有较高声誉。
神经外科目前拥有普通床位35张，专用重症监护床位（NICU）8张。附有我院第一个校级研究机构：上海交通大学医学院医神经创伤与脑血管病研究室。年出院病人600余人，年门急诊量近1万人次。目前共有医护人员30人，包括教授2名、副教授3名（含博士两名、在读博士一名、硕士五名、在读硕士一名），高学历和高职称医师占较高比例，是一个以中青年医师为主的人才梯队。
【医疗特色】
三院神经外科根据医院地处上海北翼，以宝钢和集装箱客运码头为代表的工业密集交通枢纽地的区位特点，建科伊始就确立重点以满足工业、交通、运输业一线和郊区及邻近省市广大群众对神经外科常见病、多发病的医疗需求为目标，经过30年尤其是近10年的建设发展，在医疗上已形成了自己的特色。
重度颅脑损伤的抢救及并发症的防治为重点的颅脑外伤规范化
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治疗已在该科室初具规模，高血压脑出血和颅内动脉瘤的微创手术与血管内介入治疗亦广泛开展，胶质瘤、脑膜瘤和垂体瘤等常见多发颅内肿瘤的诊治满足了北翼地区患者就地治疗的需求，近几年来还逐步开展了小儿神经外科、功能神经外科等。该科室收治的病人中，仅颅脑外伤患者累计就超过万人，较低死亡率和伤残率使该科室的颅脑损伤救治工作整体处于国内外领先水平，我院被卫生部授予国际急救网络医院；该科室较早参与上海市和国家关于高血压脑出血规范化外科治疗，尤其是微创手术外科治疗的各种研究项目，已成为上海及邻近地区开展微创治疗高血压脑出血工作的数量多、效果好的医院，受到国务院脑防办的表彰，并被指定为定点医院之一。
【学科建设】
在科研方面，该科室近10年来围绕学科重点发展方向和临床需求，开展了一系列基础与临床研究，获得各级科研资助十余项，资金上百万元，其中国家自然科学基金青年项目一项：“SLC22A18基因失活与胶质瘤恶性生物学特征的关系及其临床意义”，上海市自然科学基金数项。
在主要医学期刊上发表学术论著100多篇，其中在国外SCI杂志发表十余篇。
人才培养方面，采取“派出去（到国内外进修访问）、请进来（邀请国内外专家讲学交流）”相结合，攻读研究生与专题进修相结合的方式，培养青中年医务骨干，使该科室初步形成一支高学历和高职称的中青年医师队伍。该科室研究生培养从1994年开始至今已毕业8名，目前在读研究生10余名。该科室先后主持筹备全国生物医学物理年会2次，上海市神经外科年会1次，中日中意和中日意国际学术讨论会3次，参与上海市筹备国际国内学术会议多次，与日本、意大利、以色列等国建立定期学术交流关系，主编出版神经外科解剖动态录像，参与上海市医疗常规编写，举办颅脑损伤新进展学习班（国家级）5次，学员遍及全国各省市，帮助湖北、宁夏、云南、新疆、山东、吉林等省市建立基层神经外科和培养神经外科专业人员。
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